Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3HQ9Y535 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3HQ9Y535 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms