Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP11Q9Y3A2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP11Q9Y3A2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UTP11Q9Y3A2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms