Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP20Q9Y2K6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP20Q9Y2K6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP20Q9Y2K6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP20Q9Y2K6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP20Q9Y2K6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms