Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDAC5Q9UQL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC5Q9UQL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC5Q9UQL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC5Q9UQL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms