Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEU3Q9UQ49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEU3Q9UQ49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEU3Q9UQ49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEU3Q9UQ49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms