Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF18Q9UNG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF18Q9UNG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFSF18Q9UNG2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms