Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB23Q9ULC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB23Q9ULC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB23Q9ULC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB23Q9ULC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms