Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH9Q9ULB4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH9Q9ULB4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDH9Q9ULB4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH9Q9ULB4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH9Q9ULB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH9Q9ULB4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH9Q9ULB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH9Q9ULB4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms