Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT11Q9UKZ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT11Q9UKZ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms