Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCTPQ9UKL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCTPQ9UKL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCTPQ9UKL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCTPQ9UKL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms