Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA1Q9UIW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNA1Q9UIW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA1Q9UIW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms