Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF11Q9UIL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF11Q9UIL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF11Q9UIL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms