Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHA6Q9UF33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA6Q9UF33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms