Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK2Q9UBU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DKK2Q9UBU2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms