Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
REREQ9P2R6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
REREQ9P2R6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
REREQ9P2R6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
REREQ9P2R6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
REREQ9P2R6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
REREQ9P2R6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
REREQ9P2R6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms