Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR4Q9NYA4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR4Q9NYA4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR4Q9NYA4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR4Q9NYA4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR4Q9NYA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR4Q9NYA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR4Q9NYA4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms