Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT1Q9NXH9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT1Q9NXH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT1Q9NXH9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms