Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECAP2Q9NVZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NECAP2Q9NVZ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NECAP2Q9NVZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms