Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD2Q9NRG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMYD2Q9NRG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD2Q9NRG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD2Q9NRG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD2Q9NRG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD2Q9NRG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD2Q9NRG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD2Q9NRG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms