Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS4Q9NQG7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPS4Q9NQG7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS4Q9NQG7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS4Q9NQG7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms