Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA1Q9NP55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA1Q9NP55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BPIFA1Q9NP55 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BPIFA1Q9NP55 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms