Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUGCTQ9HAC7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUGCTQ9HAC7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUGCTQ9HAC7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUGCTQ9HAC7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms