Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1BQ9H816 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLRE1BQ9H816 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms