Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN3Q9H649 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NSUN3Q9H649 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSUN3Q9H649 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN3Q9H649 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms