Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRDQ9H2X0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRDQ9H2X0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRDQ9H2X0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.6 ms