Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC27Q9C0I9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC27Q9C0I9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms