Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCSER1Q9C0I3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCSER1Q9C0I3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCSER1Q9C0I3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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