Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCLK3Q9C098 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DCLK3Q9C098 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms