Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM5Q9C035 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM5Q9C035 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms