Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTPBP4Q9BZE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTPBP4Q9BZE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTPBP4Q9BZE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GTPBP4Q9BZE4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms