Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC106Q9BWC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC106Q9BWC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC106Q9BWC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms