Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TINF2Q9BSI4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TINF2Q9BSI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TINF2Q9BSI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TINF2Q9BSI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms