Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms