Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PYM1Q9BRP8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PYM1Q9BRP8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PYM1Q9BRP8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms