Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
MYD88Q99836 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MYD88Q99836 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MYD88Q99836 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYD88Q99836 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms