Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ABCA3Q99758 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCA3Q99758 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCA3Q99758 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCA3Q99758 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCA3Q99758 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms