Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS4Q96RK4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS4Q96RK4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS4Q96RK4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms