Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CR12Q96Q35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALS2CR12Q96Q35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CR12Q96Q35 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms