Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG1Q96Q15 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG1Q96Q15 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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