Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD27Q96NW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD27Q96NW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD27Q96NW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD27Q96NW4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms