Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC43Q96MW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC43Q96MW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC43Q96MW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms