Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf90Q96M02 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C10orf90Q96M02 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms