Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E2Q96LR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE2E2Q96LR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2E2Q96LR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms