Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLMNQ96JQ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMNQ96JQ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLMNQ96JQ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms