Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSL1Q96IY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSL1Q96IY1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms