Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC34Q96HJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC34Q96HJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 505.8 ms