Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IMP4Q96G21 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP4Q96G21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP4Q96G21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms