Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC3Q96DC8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC3Q96DC8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECHDC3Q96DC8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECHDC3Q96DC8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms