Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMD3Q96D46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMD3Q96D46 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms