Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTSSAQ969W0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTSSAQ969W0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms